Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI1Q9ULC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI1Q9ULC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI1Q9ULC6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms