Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN1Q9ULB1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NRXN1Q9ULB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN1Q9ULB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms