Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPREB3Q9UKI3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPREB3Q9UKI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms