Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP3Q9UKI2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDC42EP3Q9UKI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms