Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMPXQ9UHP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPXQ9UHP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms