Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SWAP70Q9UH65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SWAP70Q9UH65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SWAP70Q9UH65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms