Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRODH2Q9UF12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRODH2Q9UF12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRODH2Q9UF12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms