Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAJB4Q9UDY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAJB4Q9UDY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAJB4Q9UDY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAJB4Q9UDY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms