Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPR1Q9UBH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPR1Q9UBH6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms