Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D6

FAM135A, Protein FAM135A, humanhuman

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM135AQ9P2D6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FAM135AQ9P2D6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FAM135AQ9P2D6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FAM135AQ9P2D6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FAM135AQ9P2D6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FAM135AQ9P2D6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FAM135AQ9P2D6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms