Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZDHHC3Q9NYG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC3Q9NYG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms