Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC5A4Q9NY91 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A4Q9NY91 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A4Q9NY91 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms