Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 33.83□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 31.51□□□□□ -2.173e-7■■■■■ 36.5
AATFQ9NY61 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 524.81■■□□□ 1.561e-323■■■■■ 36.4
AATFQ9NY61 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 519.45■□□□□ 0.71e-323■■■■■ 36.4
AATFQ9NY61 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 215.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 36.3
AATFQ9NY61 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.371e-87■■■■■ 36
AATFQ9NY61 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.66□□□□□ -1.029e-56■■■■■ 35.7
AATFQ9NY61 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.429e-56■■■■■ 35.7
AATFQ9NY61 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.69e-56■■■■■ 35.7
AATFQ9NY61 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.98□□□□□ -1.939e-56■■■■■ 35.7
AATFQ9NY61 UNKL-212ENST00000511095 924 ntTSL 423.31■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 35.7
AATFQ9NY61 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 524.67■■□□□ 1.544e-6■■■■■ 35.6
AATFQ9NY61 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 35.6
AATFQ9NY61 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 35.6
AATFQ9NY61 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■■■ 35.6
AATFQ9NY61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.285e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.495e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 224.08■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 522.3■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 521.93■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 219.66■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 422.44■■□□□ 1.183e-56■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.963e-56■■■■■ 35.3
AATFQ9NY61 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 525.95■■□□□ 1.748e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 224.83■■□□□ 1.578e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.98e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.158e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.18e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.118e-6■■■■■ 35.2
AATFQ9NY61 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.92■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 35.1
AATFQ9NY61 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 35.1
AATFQ9NY61 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 530.93■■■□□ 2.541e-6■■■■■ 35
AATFQ9NY61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 35
AATFQ9NY61 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 35
AATFQ9NY61 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 35
AATFQ9NY61 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 35
AATFQ9NY61 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 27.08□□□□□ -1.283e-83■■■■■ 35
AATFQ9NY61 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.723e-83■■■■■ 35
AATFQ9NY61 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 34.9
AATFQ9NY61 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 34.9
AATFQ9NY61 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 34.9
AATFQ9NY61 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 34.9
AATFQ9NY61 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 34.9
AATFQ9NY61 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 314.2□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 34.8
AATFQ9NY61 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 34.8
AATFQ9NY61 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.361e-323■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.161e-14■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.36□□□□□ -1.233e-61■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.29□□□□□ -1.723e-61■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 34.7
AATFQ9NY61 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.36e-7■■■■■ 34.5
AATFQ9NY61 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 414.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 34.5
AATFQ9NY61 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 34.5
AATFQ9NY61 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 34.5
AATFQ9NY61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 23e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 425.77■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 325.77■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 321.88■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 520.76■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 220.46■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 219.61■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 34.3
AATFQ9NY61 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 34.1
AATFQ9NY61 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 34
AATFQ9NY61 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 34
AATFQ9NY61 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 34
AATFQ9NY61 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-216ENST00000591474 845 ntTSL 327.66■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-207ENST00000586837 838 ntTSL 523.61■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-211ENST00000589548 849 ntTSL 322.09■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 511.84□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 33.9
AATFQ9NY61 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 416.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.766e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-206ENST00000466550 756 ntTSL 213.83□□□□□ -0.26e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.366e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.436e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-204ENST00000326092 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.56e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-208ENST00000483765 453 ntTSL 33.71□□□□□ -1.826e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-205ENST00000461690 681 ntTSL 53.62□□□□□ -1.836e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-209ENST00000485756 675 ntTSL 22.9□□□□□ -1.956e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPL21-210ENST00000493317 438 ntTSL 21.79□□□□□ -2.126e-13■■■■■ 33.8
AATFQ9NY61 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 315.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 315.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 33.7
AATFQ9NY61 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 33.7
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