Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF38Q9NXL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF38Q9NXL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms