Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLE1Q9NVX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLE1Q9NVX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLE1Q9NVX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms