Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
PDS5BQ9NTI5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PDS5BQ9NTI5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PDS5BQ9NTI5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PDS5BQ9NTI5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PDS5BQ9NTI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms