Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP3Q9NQ35 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP3Q9NQ35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms