Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASCL3Q9NQ33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms