Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZDHHC4Q9NPG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZDHHC4Q9NPG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZDHHC4Q9NPG8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms