Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDH12Q9NPG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH12Q9NPG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH12Q9NPG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms