Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLCO1B3Q9NPD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms