Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB9Q9NP78 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCB9Q9NP78 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms