Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRPV4Q9HBA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPV4Q9HBA0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPV4Q9HBA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms