Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVMER34-1Q9H9K5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVMER34-1Q9H9K5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms