Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP13A3Q9H7F0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP13A3Q9H7F0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A3Q9H7F0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms