Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf42Q9H799 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
C5orf42Q9H799 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms