Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3Q9H3W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRN3Q9H3W5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRN3Q9H3W5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms