Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PARLQ9H300 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PARLQ9H300 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms