Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6AQ9H2E6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6AQ9H2E6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms