Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED28Q9H204 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED28Q9H204 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms