Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZC3H12CQ9C0D7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZC3H12CQ9C0D7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZC3H12CQ9C0D7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms