Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRCC1Q9C099 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRCC1Q9C099 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRCC1Q9C099 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms