Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM7Q9C029 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM7Q9C029 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM7Q9C029 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms