Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPRY4Q9C004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRY4Q9C004 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms