Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC46A2Q9BY10 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A2Q9BY10 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC46A2Q9BY10 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A2Q9BY10 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308 ms