Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B5Q9BWJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms