Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM106CQ9BVX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM106CQ9BVX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM106CQ9BVX2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms