Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN3Q9BTN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRFN3Q9BTN0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms