Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPK3BQ9BT76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPK3BQ9BT76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPK3BQ9BT76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UPK3BQ9BT76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UPK3BQ9BT76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms