Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NIPSNAP3BQ9BS92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms