Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPKQ9BS16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPKQ9BS16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPKQ9BS16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPKQ9BS16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms