Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC22CQ9BRL7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms