Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM1Q9BR11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSWIM1Q9BR11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms