Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RHOXF2Q9BQY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOXF2Q9BQY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOXF2Q9BQY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms