Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PMCHL2Q9BQD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms