Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLX1AQ9BQ83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLX1AQ9BQ83 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms