Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL4Q9BPW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL4Q9BPW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.1 ms