Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD9AQ99638 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD9AQ99638 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD9AQ99638 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms