Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOTCH4Q99466 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTCH4Q99466 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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