Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPP1R9BQ96SB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms